Plateforme dosages pharmacotoxicologiques et pharmacogénétique
Applications larges : dosages de médicaments, de stupéfiants, de composés endogènes (métabolomique ciblée, pools nucléotidiques,...), d'éléments traces (métaux), toxicologie professionnelle.
Liens forts avec la pharmacogénétique pour les anti-infectieux, des anti-douleurs, les immunosuppresseurs et les anti-cancéreux. Compétences analytiques et biologiques très larges.
Plateforme hospitalière (CHU de Lyon) de biologie moléculaire en pharmacologie et toxicologie. Applications larges aux différentes classes thérapeutiques . Liens forts avec la pharmacotoxiologie analytique pour les anti-infectieux, les immunosuppresseurs, les neuroleptiques, les antipsychotiques et les anti-cancéreux. Compétences en biologie moléculaires et pharmacologie analytique très larges. Forte valence universitaire. Développement d'outils interprétatifs
Expertises et services
Interprétation combinée entre phénotype (dosage) et génotype (pharmacogénétique):
- Plateforme de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (systèmes quadripolaire et haute résolution).
- Plateforme d'appareils de plasma à couplage inductif (ICP) avec détection par spectrométrie de masse simple (ICP-MS) ou en tandem (ICP-MS/MS) ou par spectroscopie d'émission (ICP-OES). ICP-MS couplée avec de la chromatographie liquide (LC-ICP-MS) pour spéciation.
- Screening ou identification ciblée (métabolites ou médicaments). Dosage de métaux. Compétences analytiques (extraction à partir de milieux biologiques divers comme sang, urine, tissus, lignées cellulaires, ADN, ARN). Lien fort avec la biologie moléculaire (pharmacogénétique)
- Applications larges : dosages de médicaments, de stupéfiants, de composés endogènes (métabolomique ciblée, pools nucléotidiques,...)
- Prédiction des effets iatrogènes et de résistance pharmacologiques aux médicaments.
Equipement
LC-MS/MS XEVO TQ-XS micro (Waters) x 3
LC-MS/HRMS Focus x 2
LC-MS/HRMS Q-Exactive Plus x 1
ICP-OES (Agilent) x 1
LC-ICP-MS (PerkinElmer) x 1
ICP-MS/MS (PerkinElmer) x 1
Illumina novaseq.
Illumina nextseq 500
nanopore
Responsables scientifiques : Pr Jérôme GUITTON, Pr Lea PAYEN
Localisation : Laboratoire de Biologie Médicale Multi Sites (LBMMS) des HCL
Service de Biochimie et biologie moléculaire, Centre de Biologie et Pathologie Sud, Groupement Hospitalier Sud
Définition : plateforme technologique et d'expertise
Thématique : biologie, bioinformatique, toxicologie
Discipline : Biochimie, pharmacotoxicologie, pharmacogénétique
Application médicale : toute discipline Contact
Mots clés : Biomarqueurs, Pharmacogénétique, Toxicologie, Pharmacologie, médicaments, spectrométrie de masse, stupéfiants, NGS (séquençage haut débit), élement trace et métaux, métabolisme médicamenteux, biomédicaments