Plateforme dosages pharmacotoxicologiques et pharmacogénétique

Résumé
La plateforme PETRA "Dosages pharmacotoxicologiques et pharmacogénétique" est une plateforme hospitalière de spectrométrie de masse spécialisée en pharmacologie et toxicologie et séquençage haut débit.

Applications larges : dosages de médicaments, de stupéfiants, de composés endogènes (métabolomique ciblée, pools nucléotidiques,...), d'éléments traces (métaux), toxicologie professionnelle. 
Liens forts avec la pharmacogénétique pour les anti-infectieux, des anti-douleurs, les immunosuppresseurs et les anti-cancéreux. Compétences analytiques et biologiques très larges. 
Plateforme hospitalière (CHU de Lyon)  de biologie moléculaire  en pharmacologie et toxicologie. Applications larges aux différentes classes thérapeutiques . Liens forts avec la pharmacotoxiologie analytique pour les anti-infectieux, les immunosuppresseurs, les neuroleptiques, les antipsychotiques  et les anti-cancéreux. Compétences en biologie moléculaires et pharmacologie analytique très larges. Forte valence universitaire. Développement d'outils interprétatifs

Expertises et services 

Interprétation combinée entre phénotype (dosage) et génotype (pharmacogénétique):
- Plateforme de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (systèmes quadripolaire et haute résolution). 
- Plateforme d'appareils de plasma à couplage inductif (ICP) avec détection par spectrométrie de masse simple (ICP-MS) ou en tandem (ICP-MS/MS) ou par spectroscopie d'émission (ICP-OES). ICP-MS couplée avec de la chromatographie liquide  (LC-ICP-MS) pour spéciation.
- Screening ou identification ciblée (métabolites ou médicaments). Dosage de métaux. Compétences analytiques (extraction à partir de milieux biologiques divers comme sang, urine, tissus, lignées cellulaires, ADN, ARN). Lien fort avec la biologie moléculaire (pharmacogénétique)
- Applications larges : dosages de médicaments, de stupéfiants, de composés endogènes (métabolomique ciblée, pools nucléotidiques,...)
- Prédiction des effets iatrogènes et de résistance pharmacologiques aux médicaments.
 

Equipement

LC-MS/MS XEVO TQ-XS micro (Waters) x 3
LC-MS/HRMS Focus x 2
LC-MS/HRMS Q-Exactive Plus x 1
ICP-OES (Agilent) x 1
LC-ICP-MS (PerkinElmer) x 1
ICP-MS/MS (PerkinElmer) x 1 
Illumina novaseq.
Illumina nextseq 500
nanopore

Dernière mise à jour le :
Blocs libres

Responsables scientifiques : Pr Jérôme GUITTON, Pr Lea PAYEN
Localisation : Laboratoire de Biologie Médicale Multi Sites (LBMMS) des HCL
Service de Biochimie et biologie moléculaire, Centre de Biologie et Pathologie Sud, Groupement Hospitalier Sud 
Définition : plateforme technologique et d'expertise
Thématique : biologie, bioinformatique, toxicologie
Discipline : Biochimie, pharmacotoxicologie, pharmacogénétique
Application médicale : toute discipline Contact

Mots clés : Biomarqueurs, Pharmacogénétique, Toxicologie, Pharmacologie, médicaments, spectrométrie de masse, stupéfiants,  NGS (séquençage haut débit), élement  trace et métaux, métabolisme médicamenteux, biomédicaments