Plateforme d'immuno-monitorage

Résumé
La plateforme PETRA d’immuno-monitorage translationnel et clinique regroupe les expertises biologiques en lien avec la caractérisation de la réponse immunitaire qui sont présentes au sein du Laboratoire de Biologie Médicale Multi Sites (LBMMS), laboratoire des HCL accrédité par le COFRAC pour la réalisation d’analyses de biologie médicale.

Elle propose de nombreux outils standardisés utilisant des méthodes conventionnelles ou des méthodes innovantes pour lesquelles une expertise a spécifiquement été développée au sein du LBMMS. Les expertises sont utilisées à façon afin de permettre, à partir d'échantillons biologiques, la caractérisation et le suivi de la réponse du système immunitaire dans les conditions physiologiques et pathologiques. Ces dernières incluent l’inflammation et le sepsis, la réponse anti-infectieuse, les déficits immunitaires primaires et secondaires, les maladies auto-inflammatoires, les maladies auto-immunes, les hypersensibilités et le suivi des immunothérapies.

La plateforme d’Immuno-monitorage s'appuie sur 10 Laboratoires de Biologie Médicale de Référence (LBMR) : Exploration biologique des interféronopathies, Diagnostic intégratif du myélome, Syndromes neurologiques paranéoplasiques, (SNP) ; Encéphalites auto-immunes ; Maladies inflammatoires rares du cerveau et de la moelle, Allergies, Diagnostic des déficits immunitaires héréditaires ou primitifs, Numération des lymphocytes CAR-T, Vascularite et glomérulonéphrite cryoglobulinémiques, Déficit en alpha1-antitrypsine, Maladies auto-immunes non spécifiques d’organes, Endocrinopathies auto-immunes).

Les acteurs impliqués dans cette plateforme sont membres de réseaux régionaux et nationaux, incluant  le Centre de référence des déficits immunitaires héréditaires (CEREDIH), les Réseaux FAI²R (filière de santé des maladies auto-immunes et auto-inflammatoires rares) et RAISE (Centre de référence des rhumatismes inflammatoires et maladies auto-immunes systémiques rares de l’enfant), le Centre de référence des syndromes neurologies paranéoplasiques et encéphalites auto-immunes et le centre de référence des maladies inflammatoires rares du cerveau et de la moelle, le réseau AllergoBioNet, ainsi que l’Intergroupe francophone du myélome (IFM) et l'Observatoire Auvergne-Rhône Alpes des mycobactérioses.

Concernant la réponse anti-infectieuse, elle s'appuie également sur 4 Centres Nationaux de Référence (CNR sur les virus des infections respiratoires, CNR associé sur les enterovirus, CNR des légionelles, CNR des staphylocoques), et, l'Institut des agents infectieux (Virologie, Bactériologie, Mycologie et Parasitologie) des HCL est nommé Etablissement de Santé de Référence (ESR) pour les maladies infectieuses émergentes et réémergentes.
 

Expertises et services

Expertises dans l'exploration de l'Allergie, Inflammation, Suivi des biothérapies, Maladies auto-immunes, Dyscrasies plasmocytaires, Réponses anti-infectieuses, Déficits Immunitaires, Ingénierie biologique, Expertises techniques et biologiques en immuno-monitorage.

  • Allergie et maladies apparentées 
    • Exploration et suivi biologique de l’allergie (alimentaire, respiratoire, venins d’hyménoptères, médicamenteuse) et des maladies apparentées
    • Caractérisation des profils moléculaires de sensibilisation IgE vis-à-vis des allergènes alimentaires et respiratoires, ainsi que des venins d’hyménoptères : tests conventionnels par immunodosages, et tests sur puces (ALEX)
    • Développement de tests de suivi dans le cadre des protocoles d’induction de tolérance allergénique : dosage d’IgG4 spécifiques de l’allergène d’intérêt, évaluation de l’activation des basophiles ex-vivo (TAB - Test d'Activation des Basophiles) 
    • Exploration des allergies médicamenteuses : réalisation du TAB avec divers traitements (antibiotiques, agents d’anesthésie en particulier curares, produits de contraste, chimiothérapies et biothérapies)
    • Dosage des IgE totales, dosage de cytokines TH2 (IL-5, TARC), dosage de médiateurs mastocytaires (histamine, tryptase), dosage du C1-inhibiteur (fonctionnel et pondéral)
  • Inflammation 
    • Exploration de l’inflammation associée notamment aux maladies auto-immunes et aux maladies auto-inflammatoires
    • Etude d’un large panel de médiateurs de l’inflammation : dosage de la SAA, exploration du système du complément, dosage de la tryptase, dosage unitaire ou en multiplex de cytokines/chimiokines et de récepteurs solubles de cytokines, étude de la signature transcriptomique de l’interféron (score interféron)
    • Développement d’outils permettant l’étude des biomarqueurs de l’inflammation : méthodes classiques de dosage des protéines (électrophorèse, immunoprécipitation, ELISA) et technologies plus complexes et innovantes (Nanostring,Simoa)
    • Etude de l’inflammation du système nerveux central : dosage de différentes cytokines dans le LCR, recherche de synthèse intrathécale d’immunoglobulines, dosage des chaînes légères libres dans le LCR
  • Suivi des biothérapies 
    • Immunomonitorage des patients traités par biothérapies (CAR-T, anticorps monoclonaux, ...) selon les recommandations disponibles ou éventuellement nouveaux marqueurs d'intérêt à la demande
  • Maladies auto-immunes 
    • Recherche et identification d'autoanticorps utiles au diagnostic, au pronostic et/ou au suivi des maladies auto-immunes systémiques (lupus systémique,polyarthrite rhumatoïde, syndrome de Gougerot-Sjögren, myosites, sclérodermies...) ou spécifiques d'organes (endocrinopathies auto-immunes, hépatopathies auto-immunes, maladies neurologiques auto-immunes...).
  • Dyscrasie plasmocytaire
    • Caractérisation fine des immunoglobulines monoclonales (sécrétées sous leur forme intacte ou incomplète) : techniques d’électrophorèse associée à des méthodes de fixation ou de sélection, dosage des chaînes légères libres (CLL) sériques
    • Caractérisation des cryoglobulines et cryofibrinogène
    • Recherche de complications rénales associées à la néphrotoxicité des CLL monoclonales : électrophorèse des protéines urinaires, recherche d’une protéine de Bence-Jones dans les urines
    • Dosage du VEGF-A (syndrome POEMS)
    • Développement de tests spécifiques adaptés aux biothérapies utilisés chez les patients avec myélome multiple réfractaire en suivant l’évolution de l’arsenal thérapeutique (Hydrashift, sBCMA)
  • Réponse anti-infectieuse
    • Biomarqueurs diagnostiques et thérapeutiques dans la tuberculose
    • Activité de seroneutralisation en technique standard ou en culture temps réel pour les viroses respiratoires (grippe, VRS, SARS-CoV-2), les herpesvirus et les viroses émergentes ou réémergentes (Monkeypox, MERS-CoV, grippe aviaire).
    • Production et inactivation virale servant de pool antigénique pour le développement ou la mise au point de tests immunologiques
    • Dosage chimiokine CXCL13 dans LCR (neuroborreliose précoce)
  • Déficits immunitaires
    • Exploration des déficits immunitaires cellulaires ou humoraux innés ou acquis (infection à VIH, suivi de biothérapies, reconstitution immunitaire après greffe de moelle osseuse, patients de réanimation) affectant les différentes populations lymphocytaires, polynucléaires et monocytaires.
    • Evaluation quantitative et fonctionnelle des cellules immunitaires.
  • Ingénierie biologique
    • Production d’anticorps monoclonaux humains à partir d’une technologie optimisée de différenciation/immortalisation de lymphocytes B issus de prélèvements sanguins de patients immunisés contre une cible antigénique d’intérêt (auto-antigène, antigène d’agent infectieux, etc)
  • Expertise technologique et biologique
    • Tri et purification cellulaire
    • Phénotypage multiparamétique 
    • Tests cellulaires fonctionnels à façon 
    • Dosage protéique ultrasensible
    • Modèle de granulome tuberculeux (granuloma like structure) pour évaluer les thérapies dirigées vers l'hôte

Equipement

  • Allergie
    • Puce ALEX (biopuce, multiallergénique, extraits totaux et allergènes moléculaires)
    • Cytométrie en flux - Test d'activation des basophiles (méthode accréditée COFRAC)
    • Techniques ELISA (dosage de l’histamine et de cytokines)
    • Instrument ImmunoCAP (méthodes accréditées COFRAC)
  • Inflammation
    • Instrument ELLA (ELISA, automatisé, multiplex possible)
    • Instrument Simoa pour les dosages protéiques ultra-sensibles
    • Plateforme Nanostring (signature transcriptomique IFN, méthode accréditée COFRAC, LBMR)
  • Suivi des biothérapies
    • Cytomètres Navios et Aquios (méthode accréditées COFRAC)
    • Instrument ELLA (ELISA, automatisé, multiplex possible)
    • Test Hydrashift Daratumumab/Isatuximab
    • Cytomètre DxFLEX
  • Maladies autoimmunes
    • Techniques d'immunofluorescence indirecte automatisées (sur PhDlx ou IF Sprinter XL) ou manuelles sur divers substrats: HEp-2, polynucléaires neutrophiles, cellules transfectées, tissu de rat (foie, estomac, rein, hippocampe, cervelet) ou de primate (pancréas, surrénales) (méthodes accréditées COFRAC)
    • Fluorimétrie de flux multiplexée (Bioplex2200) (méthodes accréditées COFRAC)
    • Techniques ELISA automatisées (EVOLIS) ou manuelles (méthodes accréditées COFRAC)
    • Techniques d'immunodot et de western-blot (EuroblotOne) (méthodes accréditées COFRAC)
  • Dyscrasie plasmocytaire
    • Électrophorèses en capillaire et sur gel
    • Immunofixation spécifique (chaînes légères libres kappa, chaînes légères libres lambda, IgD, IgE) (méthodes accréditées COFRAC)
    • Immunosélection (méthodes accréditées COFRAC)
    • Test Hydrashift Daratumumab/Isatuximab
    • Technique ELISA (dosage VEGF-A, dosage sBCMA)
  • Déficits immunitaires primaires et secondaires
    • Cytomètres Navios et Aquios (méthodes accréditées COFRAC)
    • Tests Quantiférons (TB et CMV)
  • Ingénierie biologique
    • Système de culture optimisé pour la culture/screening de clones lymphocytaires B d'intérêt. 
    • Production haute densité d'anticorps monoclonaux
  • Expertise technologie et biologique
    • Cytomètre spectral en projet
    • Trieur Aria BD Imagerie "live" en environnement P3
    • Cellules T et B spécifiques (infection et autres)
Dernière mise à jour le :
Blocs libres

Responsables scientifiques : Pr Fabienne Venet et Dr Anne-Perrine Foray
Localisation : Laboratoire de Biologie Médicale Multi Sites (LBMMS) des HCL
Groupement Hospitalier Sud, Groupement Hospitalier Nord, Groupement Hospitalier Centre 
Définition : plateforme technologique et d'expertise
Thématique : biologie, vaccin, intelligence artificielle, infection, inflammation, investigation clinique
Discipline : Immunologie, microbiologie
Contact

Mots-clés : statut immunitaire, immunité cellulaire, immunité humorale, cytokines, auto-anticorps, anticorps, tests fonctionnels, biothérapies, immunothérapies