Plateforme métabolomique

Résumé
La plateforme PETRA "Métabolomique" (maladie du métabolisme , METANUTRIBIOTA (métabolomique et volatolomique) et endocrinologie) est une plateforme hospitalière (CHU de Lyon) du service de biochimie localisée au sein des Centres de Biologie et Pathologie des hôpitaux Lyon Sud et Lyon-Est.

Cette plateforme propose des approches ciblées de métabolomique, lipidomique et volatolomique quantitatives par spectrométrie de masse. Compétences à la fois analytiques et biostatistiques (analyse des données).

Expertises et services :

La plateforme propose les services suivants :

  • Approche métabolomique et lipidomique ciblée quantitative par LC-MS/MS.
  • Approche volatolomique pour quantification des composés organiques volatils par GC-MS couplée à un module de thermodésorption (TD/GC-MS). 
  • Compétences à la fois analytiques et biostatistiques permettant d'identifier des signatures métabolomiques discriminantes.
    -> métabolites associés à des variations de composition du microbiote (sérum, urine, selles, air expiré, …)
  • Compétences à la fois analytiques et biostatistiques permettant d'identifier des signatures métabolomiques discriminantes.
    -> métabolites associés à des variations de composition du microbiote (sérum, urine, selles, air expiré, …)

Equipements

LC-MS/MS XEVO TQ-XS (Waters)
TD-GC-MS (AGILENT (GC-MS)
MARKES (module de thermodésorption CENTRI) assemblé par SRA -> TD/GC-MS dans les locaux du CRNH (Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes)
 

Dernière mise à jour le :
Blocs libres

Responsables scientifiques : Dr Karim Chikh (métabolomique) / Dr Florence Roucher-Boulez (endocrinologie) / Dr David Cheillan (maladie du métabolisme)
Localisation : Laboratoire de Biologie Médicale Multi Sites (LBMMS) des HCL
Service de Biochimie et Biologie moléculaire, Centre de Biologie et Pathologie Sud, Groupement Hospitalier Sud 
Service de Biochimie et Biologie moléculaire, Centre de Biologie et Pathologie Est , Groupement Hospitalier Est 
Définition : plateforme technologique et d'expertise
Thématique : biologie
Discipline : biochimie 
Application médicale : gastro-entérologie, néphrologie, hépathologie, neurologie, biologie, endocrinologie et métabolisme, gériatrie, nutrition, rhumatologie, cancer, infectiologie, toutes les pathologies modifiant le métabolisme et le microbiote
Contact

Mots clés : biomarqueurs, métabolomique, volatolomique, microbiote, lipidomique, endocrinologie, maladies héréditaires du métabolisme