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Ce projet, coordonné par l'INSERM, s'appuie sur des données montrant que les facteurs liés au mode de vie et la pratique de la méditation ont le potentiel de réguler à la baisse ces facteurs négatifs et d'avoir un impact positif sur les maladies mentales et neurologiques, y compris la maladie d'Alzheimer
Le projet TopSurgeons est coordonné par l'Université Claude Bernard, Lyon 1 (UCBL) et inclue les Hospices Civils de Lyon (HCL) en tant que tierce partie. Ce projet vise à développer des solutions pour optimiser la condition physique et mentale des chirurgiens pendant l'opération et pour permettre à ces derniers d'être plus efficaces dans leur travail. physique et mentale des chirurgiens pendant l'opération et permettre une chirurgie de haute qualité.
Coordonné par l'INSERM, le projet EU-RESPONSE a pour objectif de concevoir et de mener un nouvel essai européen adaptatif sur COVID-19 et les maladies infectieuses émergentes.
EPIAROUSAL est un projet européen mené par le Pr Sylvain RHEIMS, coordonné par l'université Lyon 1 Claude Bernard (UCBL). L'objectif est de valider que thérapie ciblée sur l'adénosine peut restaurer l'éveil normal induit par l'asphyxie dans les cas d'épilepsie résistante aux médicaments, ouvrant ainsi la voie à un premier essai clinique de prévention de la SUDEP.
Conect4children est un large réseau réseau européen dont l'objectif est de faciliter le développement de nouveaux médicaments et d'autres thérapies pour les enfants. Ce projet est porté par la fondation PENTA (Italie)
CARDIATEAM est un projet européen mené par l'Institut National de la Sante Et de la Recherche Médicale
(INSERM) et dont les HCL sont partenaires. Il vise à déterminer dans quelle mesure la cardiomyopathie diabétique est distincte des autres formes d'insuffisance cardiaque et dans quelle mesure le diabète de type 2 contribue à son développement et à sa progression.
Le consortium ISIDORe a pour vocation d’améliorer les services et la recherche européenne sur les agents pathogènes potentiellement épidémiques.

Pathologies tumorales, pathologies auto-immunes, pathologies hématopoïétiques
Installé au centre de biologie de l'hôpital Lyon Sud, la plateforme d’imagerie moléculaire offre une analyse très fine d’échantillons de tissus même en faible quantité ou dégradé et permet notamment d’adapter le traitement à la tumeur et au patient pour en augmenter l’efficacité tout en limitant la toxicité.
L’Observatoire Français de la Sclérose en Plaques (OFSEP) est un outil épidémiologique sur la SEP à destination de la communauté scientifique française et internationale.
Au vu de ces forces, ainsi que de leur positionnement dans un écosystème régional favorable, les cliniciens ont constitué en 2022 l' Institut de Recherche Clinique en Neurosciences Pierre Wertheimer ou IPW, portant sur l’ensemble des problématiques de recherche autour des pathologies neurologiques et neurochirurgicales.
SALVOVAR est un projet européen mené par les HCL, destiné :
- A sensibiliser les médecins et à proposer des outils de diagnostic pratiques et abordables pour identifier ces patientes.
- A évaluer l'utilité, l'acceptabilité (qualité de vie ; perception du patient) et l'accessibilité financière (rapport coût-efficacité, coût d'investissement, y compris les politiques de couverture des pays) des solutions basées sur l'ajustement de leur traitement médico-chirurgical.
Ces dernières années, grâce aux progrès des technologies d'imagerie (telles que l'IRM, la TEP, la CT, entre autres), la localisation clinique des lésions du système nerveux central (SNC) avant l'intervention chirurgicale a permis aux neurochirurgiens de planifier et de s'éloigner des zones fonctionnelles du cerveau lors de l'ablation des tumeurs. Cependant, la neuronavigation dans la gestion chirurgicale des tumeurs cérébrales reste un défi important, en raison de l'incapacité à conserver des informations spatiales précises sur les zones lésionnées et non lésionnées pendant l'opération.
Le Site de Recherche Intégrée en Cancérologie LYriCAN (LYon recherche Innovation contre le CANcer) est labellisé par l’Institut national du Cancer depuis 2011.
L'objectif du projet INSPIRE est de tester l'efficacité clinique et le coût d'une intervention intégrée de réhabilitation palliative précoce pour améliorer les fonctions et la qualité de vie des personnes atteint d'un cancer incurable.
Depuis 20 ans, les Hospices Civils de Lyon et bioMérieux collaborent dans le cadre d’un partenariat de recherche public/privé innovant. Rejoint en 2016, par l’Université Claude Bernard Lyon 1, les trois institutions travaillent à décrypter les mécanismes de l’immunité pour développer des tests diagnostiques.
Le Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes travaille à l’amélioration de l’alimentation pour la santé et le bien-être de l’Homme. Il développe des programmes de recherche en nutrition dans le cadre des appels d’offres nationaux, européens et internationaux et collabore avec les industriels et les chercheurs de grands groupes mondiaux.
Les fédérations hospitalo-universitaires (FHU) ont pour objectif de dynamiser la recherche et d’améliorer la qualité des soins par une diffusion plus rapide des innovations en associant l’hôpital, l’université et les organismes de recherche.
L’essai clinique Discovery est un grand essai académique européen évaluant des antiviraux dans le COVID-19. Promu par l’Inserm, il est piloté à l'hôpital de la Croix-Rousse par la Pr Florence Ader.
Depuis début mars 2020, médecins, paramédicaux, attachés de recherche, techniciens de laboratoires, directeurs et personnels administratifs travaillent de concert pour mieux comprendre le Covid-19, adapter la prise en charge des patients en temps réel mais aussi trouver des solutions diagnostiques et thérapeutiques.
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Le programme "Beating Cancer" de l'Europe a appelé à la mise en place d'un nouveau programme de dépistage du cancer soutenu par l'UE afin d'assurer la performance des programmes de dépistage du cancer dans tous les États membres (EM).
L'objectif général du projet EUCanScreen est d'assurer la mise en œuvre durable de dépistage de haute qualité pour le cancer du sein, le cancer du col de l'utérus et le cancer colorectal, ainsi que la mise en œuvre des programmes de dépistage
récemment recommandés - pour les cancers du poumon, de la prostate et de l'estomac.
Dans le cadre du programme Europe Numérique (DIGITAL), la Commission Européenne a ouvert des appels à projets pour financer des installations de test et d'expérimentation sectoriels de l'IA (TEF : Testing and Experimental Facilities). Le TEF HEALTH a pour vocation de favoriser l'intégration des technologies de pointe en matière d'IA et de robotique dans le domaine de la santé. Il stimulera l'industrie européenne des soins de
santé en se concentrant sur l'applicabilité et en facilitant le processus complexe et long d'innovation en IA.

Le projet ESENBURN, coordonné par les HCL, a pour objectif de créer, structurer et soutenir un réseau de fabricants de produits biologiques, de centres de traitement des brûlures, de sites de validation préclinique, les organismes de réglementation, les départements de R&D pour évaluer, stimuler et sécuriser les applications cliniques des médicaments de thérapie avancée (ATMP)  pour les patients brûlés.
Plus de 20 millions de citoyens européens atteints d'une maladie neurologique (nombre croissant) ont besoin de réadaptation. Les modèles de soins actuels ne sont pas en mesure de fournir une réponse efficace et rentable. Le projet NeuroRehab4EU a pour objectif de proposer un modèle durable de neuroréadaptation à l'échelle de l'UE, tout au long du continuum de soins.
Le projet HAP2 est de révolutionner la gestion des PAH en capitalisant sur le nouveau concept d’immunosuppression liée à une maladie critique modifiant les interactions hôte-pathogènes, l'idée est de proposer une réévaluation complète de la physiopathologie des PAH basée sur le concept de dysbiose respiratoire.
L'objectif du projet ANGELA est d'évaluer le rendement diagnostique du Cytosponge combiné à des biomarqueurs tissulaires et à des biomarqueurs moléculaires pour la détection du carcinome épidermoïde de l'œsophage.
Le consortium oncNGS souhaite répondre aux besoins médicaux non satisfaits identifiés pour tous les patients atteints de cancer en établissant une stratégie commune de profilage des tumeurs permettant d'offrir à tous un accès égal aux traitements innovants, en réalisant des analyses de recherche sur les résultats après les traitements avec des thérapies ciblées et en limitant
les inégalités dues aux coûts élevés des tests de diagnostic.